El Lugar de Importancia Comunitaria de la Desembocadura del Coghinas se caracteriza por su entorno predominantemente fluvial, ya que incluye el territorio de la desembocadura del Coghinas y su tramo costero. El sistema dunar alberga diversas especies autóctonas y la vegetación se compone principalmente de juncos y carrizos, que dan cobijo a más de 130 especies de aves: entre ellas, garzas, gaviotas, aguiluchos laguneros, cernícalos, martines pescadores, fochas y cigüeñuelas. El agua es dulce en su mayor parte y sólo cerca del último tramo de la desembocadura hay intercambio con agua salada.